首次基因组分析有助认识巴西寨卡病毒暴发
【据《Science》2016年4月报道】题:寨卡病毒在美洲:早期的流行病学和遗传研究成果(作者Nuno Rodrigues Faria等)
目前寨卡病毒(ZIKV)在巴西空前流行,患病人数高达30,000例,寨卡病毒于2015年5月首次在巴西被确认,经研究发现新生儿小头畸形可能与寨卡病毒感染存在潜在的关联。2015年11月,来自英国牛津大学和巴西Evandro Chagas研究所等机构的研究人员对巴西的寨卡病毒暴发进行首次基因组分析,研究人员对7株巴西寨卡病毒毒株的基因组进行测序,包括一株毒株来自1例致命的成年人病例和另一株毒株来自1名小头畸型的新生儿。这一分析证实美洲的寨卡病毒是由单次病毒输入后而产生的,据估计这次输入发生于2013年5月和12月之间,比首次在巴西检测到寨卡病毒的时间早了12个月。这种估计的起源时间与从寨卡病毒地方性流行地区到达的飞机乘客人数增加相一致,而且也与报道的太平洋岛屿寨卡病毒暴发时间相一致。
来自巴西寨卡病毒的基因组在系统发育上与其他南美和加勒比等国家相关联,映射突变到现有的结构模型上揭示了存在爆发谱系病毒的氨基酸变化,但是在当前可用的3个小头畸形的病毒基因组中没有发现可以共享的氨基酸变化,通过发病率的数据表明,巴西疑似小头畸形的病例报告与怀孕17周左右的寨卡病毒感染率的关联性最好,不过研究人员也强调这并不能证明这两者之间存在因果关系,确定寨卡病毒是否是小头畸型和其他疾病的病因的研究仍在继续开展中。来自牛津大学和Evandro Chagas研究所的Nuno Rodrigues Faria博士说:“这是首次利用基因组数据研究巴西寨卡病毒暴发。它为我们进一步开展研究奠定良好的基础。”
(杨慧宁 于宛平 报道)